Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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