Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms