Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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