Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms