Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMF1P82094 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms