Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA4AP68366 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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