Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms