Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
COPAP53621 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms