Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA4P51532 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms