Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT8P50990 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT8P50990 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCT8P50990 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCT8P50990 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCT8P50990 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCT8P50990 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCT8P50990 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCT8P50990 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCT8P50990 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms