Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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