Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NESP48681 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NESP48681 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NESP48681 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms