Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCAMP43121 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCAMP43121 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCAMP43121 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCAMP43121 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCAMP43121 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCAMP43121 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCAMP43121 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCAMP43121 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCAMP43121 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCAMP43121 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCAMP43121 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MCAMP43121 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCAMP43121 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCAMP43121 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCAMP43121 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCAMP43121 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCAMP43121 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCAMP43121 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCAMP43121 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MCAMP43121 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms