Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms