Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM23P36406 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms