Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJC1P36383 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJC1P36383 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms