Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CASQ1P31415 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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