Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms