Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms