Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBSLP0DN79 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBSLP0DN79 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBSLP0DN79 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBSLP0DN79 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CBSLP0DN79 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBSLP0DN79 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBSLP0DN79 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBSLP0DN79 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CBSLP0DN79 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBSLP0DN79 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBSLP0DN79 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms