Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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