Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBNO60934 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBNO60934 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBNO60934 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBNO60934 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBNO60934 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NBNO60934 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBNO60934 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NBNO60934 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBNO60934 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBNO60934 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBNO60934 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBNO60934 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms