Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COCHO43405 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COCHO43405 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms