Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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