Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT52Q9Y366 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms