Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms