Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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