Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms