Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms