Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

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Length 977 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRPC4Q9UBN4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TRPC4Q9UBN4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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