Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CPNE7Q9UBL6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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CPNE7Q9UBL6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CPNE7Q9UBL6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CPNE7Q9UBL6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CPNE7Q9UBL6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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