Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC180Q9P1Z9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC180Q9P1Z9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC180Q9P1Z9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC180Q9P1Z9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC180Q9P1Z9 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC180Q9P1Z9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC180Q9P1Z9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC180Q9P1Z9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC180Q9P1Z9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC180Q9P1Z9 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms