Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms