Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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