Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms