Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFDQ9GZP0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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