Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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