Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC2Q9C0B9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms