Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KATNB1Q9BVA0 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms