Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM208Q9BTX3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms