Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms