Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms