Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDCA3Q99618 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms