Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF479Q96JC4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF479Q96JC4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms