Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms