Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHMTQ93088 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms