Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP13Q92995 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP13Q92995 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP13Q92995 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP13Q92995 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP13Q92995 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP13Q92995 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP13Q92995 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP13Q92995 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms