Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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