Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms