Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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